1983年，北京协和医院设立独立的急诊科，这也是中国建立的第一个急诊科，被誉为“中国急诊医学第一人”邵孝鉷教授为第一任急诊科主任。

1985年，北京协和医院急诊科成为了中国第一批急诊医学硕士学位授权点，并于2003年再次成为了中国第一批急诊医学博士学位授权点；现任科主任于学忠教授就是中国首批毕业的急诊医学硕士生。

1987年，在北京协和医院等单位发起下，组建成立了中华医学会急诊医学分会，邵孝鉷当选为为第一任中华医学会急诊医学分会主任委员。

2005年，协和医院成为北京市第一批急诊住院医师规范化培训基地。

2008年6月，协和医院急诊科被确定为北京市急诊住院医师规范化培训临床技能考核中心。

2009年，于学忠教授当选为中国医师协会急诊医师分会第一任会长并连任至今。

2010年，北京协和医院急诊科成为北京市急诊质量控制和改进中心主任委员单位。

2012年，北京协和医院急诊科成为国家卫生计生委急诊质控中心主任委员单位。

2013年，于学忠教授当选为中华医学会急诊医学分会主任委员。

截至2017年，急诊科具有专科医护人员140余人，其中，主任医师3人、副主任医师5人（其中博士研究生导师3人、硕士研究生导师3人）、主治医师11人，主治以上医师均具有欧美等发达国家学习经历。每年培养研究生4~6人，每年招收急诊住院医师10人、进修医师40人左右。2002年起承担协和医科大学8年制本科生急诊医学教学，2004年起承担北京市急诊住院医师规范化培训工作。 

急诊科已经建立了完整的急诊流水区、急诊抢救室、急诊留观区、急诊病房、急诊ICU服务体系。其中东院区建筑面积8000多平米，共有留观床41张、急诊抢救床21张、急诊综合病房床位27张、急诊重症监护病房床位13张。目前平时急诊工作量约500人/日，周末或节假日工作量600人/日；年均抢救患者4000例，年均行气管插管、机械通气患者500余例。